ChemSketch漢化版是一款專業(yè)的化學(xué)結(jié)構(gòu)式編輯器,這款軟件即可作為獨(dú)立軟件使用也可以和其他軟件共用。ChemSketch漢化版可用于畫化學(xué)結(jié)構(gòu)、反應(yīng)和圖形,也可用于設(shè)計(jì)與化學(xué)相關(guān)的報(bào)告和演講材料。該軟件一個(gè)重要功能是能夠自動(dòng)計(jì)算所繪結(jié)構(gòu)式的分子式、分子量、摩爾體積、摩爾折射率、折光率、表面張力、密度、介電常數(shù)、極化率等數(shù)據(jù),免除人工計(jì)算的煩惱。
軟件功能:
ACD / 3D Viewer是一種快速而準(zhǔn)確的3D建模和可視化程序。它與ACD / ChemSketch完全集成,允許您繪制2D結(jié)構(gòu),并在醒目的16色顯示中快速獲得3D表示。使用ACD / 3D Viewer可以:
操作3D模型:移動(dòng),2D和3D旋轉(zhuǎn),也以固定角度調(diào)整大小,更改樣式和顏色;
顯示3-D結(jié)構(gòu),如棍棒,棒球,球體或磁盤;
將大點(diǎn)范德華半徑級(jí)別的小點(diǎn)疊加到固體3-D結(jié)構(gòu)上;
測(cè)量和改變鍵長度,接合角度和扭轉(zhuǎn)角度;
使用3-D CHARMM型力場(chǎng)優(yōu)化結(jié)構(gòu);
點(diǎn)擊一個(gè)按鈕,在ChemSketch窗口中從3D切換到2D顯示;
將3D分子設(shè)置為自動(dòng)旋轉(zhuǎn),有或沒有改變結(jié)構(gòu)顯示的風(fēng)格;
旋轉(zhuǎn)并移動(dòng)選定的原子,而不是整個(gè)結(jié)構(gòu)。
更改和刪除原子,將旋轉(zhuǎn)中心分配給原子。
創(chuàng)建電影并將其另存為.GIF文件;
以視角查看3D結(jié)構(gòu);和
將3D模型導(dǎo)出到其他幾何優(yōu)化程序,并將其用作良好的起始配置。
ChemSketch怎么畫好看的分子式:
使用shift鍵,按住shift鍵可以省略掉一個(gè)鍵長,下圖為不按shift鍵和按住shift鍵的區(qū)別
使用ctrl鍵,下圖為不按ctrl鍵和按住ctrl鍵的區(qū)別,按住ctrl鍵只能畫出一個(gè)鍵長的整數(shù)倍的長度,而不按的話會(huì)出現(xiàn)任意長度。
設(shè)置特定格式,投不同的雜志就要按照不同格式畫圖,如下圖選擇【tools】-【structure properties】,點(diǎn)擊【current style】下面的倒三角即可選擇不同雜志要求的格式如RSC格式,ACS格式,選好后設(shè)定為默認(rèn)格式即可。
結(jié)構(gòu)式優(yōu)化,有時(shí),畫的圖鍵長有長有短很難看,這是可以使用結(jié)構(gòu)優(yōu)化功能,如圖選中要優(yōu)化的結(jié)構(gòu)式,然后點(diǎn)擊工具欄中的【clean structure】 即可
官能團(tuán),有些官能團(tuán)畫起來很麻煩,別急在右邊欄有常見官能團(tuán)結(jié)構(gòu)式,點(diǎn)擊后直接就可以畫了
常見問題:
如何復(fù)制結(jié)構(gòu)(ACD / Dictionary)
ACD / Dictionary允許您將找到的結(jié)構(gòu)復(fù)制到ChemSketch窗口或剪貼板,或?qū)⑵鋵?dǎo)出到MDL molfile。
要將當(dāng)前顯示的結(jié)構(gòu)復(fù)制到剪貼板,請(qǐng)右鍵單擊標(biāo)題欄或“ACD /字典”對(duì)話框的“結(jié)構(gòu)”區(qū)域,然后從出現(xiàn)的快捷菜單中選擇“復(fù)制到剪貼板”。要使用其名稱復(fù)制結(jié)構(gòu),請(qǐng)?jiān)诳旖莶藛沃羞x擇帶有勾號(hào)的“使用名稱復(fù)制結(jié)構(gòu)”命令,然后單擊“復(fù)制到剪貼板”。
要將結(jié)構(gòu)復(fù)制到ChemSketch窗口,請(qǐng)?jiān)凇癆CD /字典”對(duì)話框中單擊“確定”。要使用其名稱復(fù)制結(jié)構(gòu),請(qǐng)?jiān)诳旖莶藛沃羞x擇“使用名稱復(fù)制結(jié)構(gòu)”命令并勾選。
要將結(jié)構(gòu)導(dǎo)出為MDL molfile,請(qǐng)右鍵單擊標(biāo)題欄或“ACD /字典”對(duì)話框的“結(jié)構(gòu)”區(qū)域,然后從出現(xiàn)的快捷菜單中選擇“導(dǎo)出到Molfile”。在顯示的對(duì)話框中,指定要保存當(dāng)前顯示的化學(xué)結(jié)構(gòu)的MDL molfile的名稱和位置。
如何從名稱生成結(jié)構(gòu)(ACD / Name to Structure)
ACD / ChemSketch允許您從繪圖和結(jié)構(gòu)模式中的名稱生成結(jié)構(gòu)。您可以使用以下方法之一:
從對(duì)話框生成
1.在工具菜單上,指向生成,然后從名稱中選擇結(jié)構(gòu)。
2.在出現(xiàn)的“ACD /結(jié)構(gòu)名稱”對(duì)話框中,鍵入名稱或在“名稱”框中選擇一個(gè)名稱(在此框中,放置先前已生成結(jié)構(gòu)的名稱)。
3.單擊選項(xiàng),在出現(xiàn)的“ACD /結(jié)構(gòu)名稱到結(jié)構(gòu)選項(xiàng)”對(duì)話框中,指定要生成結(jié)構(gòu)的所需選項(xiàng),然后單擊“確定”。
4.單擊運(yùn)行。生成的結(jié)構(gòu)(如果有)將顯示在“結(jié)構(gòu)”選項(xiàng)卡上;如果為您的查詢生成了幾個(gè)結(jié)構(gòu),則每個(gè)結(jié)構(gòu)都將顯示在單獨(dú)的選項(xiàng)卡上。
從ChemSketch窗口生成
1.從任何文本編輯器復(fù)制所需的名稱,并將其粘貼到ChemSketch窗口中。確保選中包含該名稱的文本框。
2.在“常規(guī)”工具欄上,單擊“從名稱生成結(jié)構(gòu)中生成結(jié)構(gòu)”。如果在沒有任何警告消息的情況下成功生成結(jié)構(gòu),則會(huì)自動(dòng)粘貼到名稱附近,否則會(huì)出現(xiàn)“ACD / Name to Structure”對(duì)話框。
一旦結(jié)構(gòu)成功生成,單擊復(fù)制并粘貼工作區(qū)中的結(jié)構(gòu)。請(qǐng)注意,在粘貼之前,您可以按TAB鍵翻轉(zhuǎn)結(jié)構(gòu)陰影。
如何保存結(jié)構(gòu)列表(ACD / Dictionary)
完成高級(jí)搜索后,您可以將列表保存到將來可以節(jié)省您的時(shí)間的文件中:
1.右鍵單擊ACD / Dictionary對(duì)話框的結(jié)構(gòu)區(qū)域或標(biāo)題欄。
2.從出現(xiàn)的快捷菜單中選擇保存列表。
3.在出現(xiàn)的“保存搜索列表”對(duì)話框中,指定要保存結(jié)果的.DCT文件的名稱和位置。
4.單擊保存。 要加載先前保存的列表,請(qǐng)從快捷菜單中選擇加載列表