InterViewer蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析軟件

InterViewer蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析軟件是生物信息工程中最基本也是最重要的數(shù)據(jù)之一 -，通常都需要使用專業(yè)的繪圖工具InterViewer才能夠處理。蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)經(jīng)常包括數(shù)千或更多節(jié)點(diǎn)的，這嚴(yán)重地限制了許多圖表的繪圖工具的實(shí)用性，因?yàn)樗麄兂蔀榫W(wǎng)絡(luò)的交互式anal- ysis太慢，因?yàn)樗鼈儺a(chǎn)生混亂附圖與許多邊交叉。我們提出了一個(gè)新的，非�？焖俚牟季炙惴�及其實(shí)現(xiàn)，叫做InterViewer3可視化大規(guī)模的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)。

使用方法

（1）首先找到整個(gè)網(wǎng)絡(luò)的連接的部件的布局，

（2）發(fā)現(xiàn)與所連接的組件中相對(duì)于樞軸節(jié)點(diǎn)的節(jié)點(diǎn)的全球布局，

（3）細(xì)化每個(gè)被連接成分的由第一重新定位的本地布局midnodes就其cutvertices和cutvertices的直接鄰國(guó)，然后通過重新定位的所有節(jié)點(diǎn)相對(duì)于他們的鄰居在距離2的優(yōu)勢(shì)

圖形繪制方法：

（1）這是一個(gè)數(shù)量級(jí)的速度更快，

（2 ）它可以直接可視化從蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫(kù)中的數(shù)據(jù)

（3）它提供了幾個(gè)操作為有效探索大規(guī)模蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)。