LigandScout for Mac

LigandScout是一個藥物研究軟件工具，用三維的受體、底物 構(gòu)建藥效團(tuán)模型，結(jié)合虛擬篩選，是基于結(jié)構(gòu)藥物設(shè)計必不可少的工具。LigandScout支持多種常用的藥效團(tuán)格式，可以導(dǎo)出模型給Catalyst (Discovery Studio)、MOE與Phase (Schrodinger)等軟件進(jìn)行虛擬篩選以保證最大的協(xié)同工作能力。功能齊全的3D圖形用戶界面支持多層級撤銷（undo），使得復(fù)雜地活性位點(diǎn)分 析與藥效團(tuán)建模變得高效、簡單明了。我們設(shè)計了結(jié)合位點(diǎn)分析、基于藥效團(tuán)的疊合以及共有藥效團(tuán)特征的創(chuàng)建等應(yīng)用使得LigandScout成為基于結(jié)構(gòu)設(shè) 計與虛擬篩選的必備工具。Ligandscout還支持所有常見的操作系統(tǒng)。

免費(fèi)測試

您可以下載一個全功能的版本，注冊后可以獲得一個月的測試授權(quán)。如果您需要更長時間的測試或預(yù)定一個測試時間、或想獲取更多信息或有技術(shù)問題要咨詢，請聯(lián)系我們。

請您附上您的信息：
姓名：
頭銜：如果是學(xué)生，請附上您指導(dǎo)老師的信息
單位：比如中山大學(xué)
單位地址：用街道名稱，比如廣州市天河區(qū)龍口東路38號2002室
所在部門：比如藥學(xué)院
Email：
電話：
請將您的信息發(fā)送到info@molcalx.com, 我們確認(rèn)了您的信息之后會給您發(fā)軟件序列號。

操作步驟

用四字母代碼下載PDB文件，比如1KE6；

找對正確的配體；

聚焦于活性位點(diǎn)，并切換到活性位點(diǎn)視圖；

檢查并修正配體的化學(xué)結(jié)構(gòu);

點(diǎn)擊建立基于結(jié)構(gòu)的藥效團(tuán)模型

實(shí)例描述

1. 在屏幕右上角鍵入’1KE6′, 點(diǎn)擊按鈕’Download 1ke6′
蛋白結(jié)構(gòu)會被下載下來并展示出來。

2. 點(diǎn)擊黃色盒子
會自動居中放大顯示該配體。

3. 鑒于PDB結(jié)構(gòu)可能有誤，需要仔細(xì)檢查：比如原子類型、鍵的類型等
你可以對原子或鍵進(jìn)行編輯，糾正，直到完全正確無誤

4.  一旦配體的化學(xué)結(jié)構(gòu)正確，按‘Ctrl-F9’組合鍵生成藥效團(tuán)模型 （在Mac OS X里是Cmd-F9）。
你也可以點(diǎn)擊‘Create Pharmacophore’按鈕來創(chuàng)建藥效團(tuán)模型。最后你可以保存這個模型給MOE，Catalyst，Phase，F(xiàn)RED等使用。